scsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.scsR

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见scsR．

SiRNA对种子脱靶效应的校正

Bioconductor版本:3.10

修正了全基因组siRNA筛选的种子介导脱靶效应。适合的功能，以识别有效的种子/ mirna和可视化他们的影响也提供在包。

作者:Andrea Franceschini

维护者:Andrea Franceschini < Andrea . Franceschini at isb-sib。ch>， Roger Meier < Roger。Meier在lmsc.ethz。Christian von Mering in imls.uzh.ch>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("scsR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“scsR”)

PDF	R脚本	scsR装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	预处理，软件
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(6年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.14.0)，STRINGdb、方法、BiocGenerics，Biostrings，IRanges，plyr, tcltk
进口	sqldf，哈希，ggplot2，图形，grDevices，RColorBrewer
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	scsR_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	scsR_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	scsR_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scsR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scsR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/scsR/
软件包下载报告	下载数据