seqtools

doi:10.18129/b9.bioc.seqtools

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅seqtools

FASTQ文件上核苷酸,序列和质量内容的分析

生物导体版本:3.10

分析在未压缩和压缩的FASTQ文件上读取长度,PHRED分数和字母频率以及DNA K-MER。

作者:Wolfgang Kaisers

维护者:Wolfgang Kaisers

引用(从r内,输入引用(“ seqtools”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ seqtools”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ seqtools”)

PDF R脚本 介绍
PDF R脚本 seqtools_qual_report
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 QualityControl,,,,测序,,,,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(5。5年)
执照 艺术2.0
要看 方法,utils,Zlibbioc
进口
链接 Zlibbioc
建议 运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 QCKITFASTQ
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 seqtools_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 seqtools_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) seqtools_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqtools
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqtools
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/seqtools/
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