shinyMethyl

DOI:10.18129 / B9.bioc.shinyMethyl

这个包是版本3.10的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见shinyMethyl。

Illumina甲基化阵列的交互式可视化

Bioconductor版本:3.10

用于可视化Illumina甲基化阵列数据的交互式工具。支持450k和EPIC阵列。

作者:Jean-Philippe Fortin [cre, aut]， Kasper Daniel Hansen [aut]

维护者:Jean-Philippe Fortin

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"，悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("shinyMethyl")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“shinyMethyl”)

PDF	R脚本	shinyMethyl: Illumina 450K甲基化阵列的交互式可视化
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，微阵列，预处理，质量控制，软件，TwoChannel
版本	1.22.0
在Bioconductor中	BioC 3.0 (R-3.1)(5.5岁)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),闪亮的(> = 0.13.2),minfi(> = 1.18.2),IlluminaHumanMethylation450kmanifest，matrixStats， r (>= 3.0.0)
进口	RColorBrewer
链接
建议	shinyMethylData，minfiData，BiocStyle，RUnit，消化，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	shinyMethyl_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	shinyMethyl_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	shinyMethyl_1.22.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/shinyMethyl
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/ shiny甲基
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/shinyMethyl/
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