规格

doi:10.18129/b9.bioc.specl

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅规格

SPECL-准备肽光谱匹配匹配,以用于靶向蛋白质组学

生物导体版本:3.10

提供了用于生成可用于蛋白质组学中MRM SRM MS工作流程的光谱库的功能。该软件包提供了Bibliospec读取器,该功能可以使用FastA格式化的氨基酸文件添加蛋白质信息,以及用于在Spectronaut软件中使用创建库的导出方法。

作者:克里斯蒂安·潘斯[AUT,CRE],乔纳斯·格罗斯曼[aut],Christian Trachsel [Aut],Witold E. Wolski [CTB]

维护者:Christian Panse

引用(从r内,输入引用(“ Specl”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ specl”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ specl”)

html R脚本 自动工作流程
PDF R脚本 规格简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 质谱,,,,蛋白质组学,,,,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(5。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.6),DBI(> = 0.5),方法(> = 3.3),PROTVIZ(> = 0.4),rsqlite(> = 1.1),seqinr(> = 3.3)
进口
链接
建议 生物基因,,,,生物使用(> = 2.2),尼特(> = 1.15),rmarkDown,,,,运行(> = 0.4)
系统要求
增强
URL //www.andersvercelli.com/packages/specl/
BugReports https://github.com/fgcz/specl/issues
取决于我
进口我
建议我 MSQC1,,,,雏形
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 specl_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 specl_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) specl_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/specl
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/specl
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/specl/
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