翻译
doi：10.18129/b9.bioc.translatome
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅翻译。
多个基因表达之间的比较
生物导体版本：3.10
在不同水平的基因表达（转录组，翻译组，蛋白质组）之间比较两种生物条件（治疗，未经治疗的患病与正常，突变体与野生型）的差异表达基因（DEG），使用几个统计方法：等级产品，翻译效率，t检验，Limma，Anota，Deseq，Edger。使用散点图，直方图，MA图，标准偏差（SD）图，变异系数（CV）图绘制结果的可能性。在先前针对两个表达水平的DEG列表中检测明显富集后的转录后调节因子（RBP，miRNA等）和基因本体术语。GO术语的比较仅在其中一个级别或两者中丰富。来自两个表达式水平的丰富GO术语列表之间的语义相似性得分的计算。视觉检查和比较富集的术语与热图，雷达图和小花。
作者：Toma Tebaldi，Erik Dassi，Galena Kostoska
维护者：toma tebaldi
引用（从r内，输入引用（“翻译”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ translatome”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Translatome”）
| R脚本 | 翻译 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 生物信息学，，，，细胞生物学，，，，差异性，，，，去，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，高通量序列，，，，微阵列，，，，多蛋白酶，，，，QualityControl，，，，规定，，，，软件 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.13（R-3.0）（6。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 2.15.0），方法，林玛，，，，Sigpathway，，，，Anota，，，，deseq，，，，EDGER，，，，rankprod，，，，topgo，，，，org.hs.eg.db，，，，Gosemsim，，，，热倍，，，，GPLOTS，，，，plotrix，，，，生物酶 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Translatome_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Translatome_1.24.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Translatome_1.24.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/translatome |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/translatome |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/translatome/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
