此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见的作用.
Bioconductor版本:3.10
该包旨在从单细胞RNA-seq数据中揭示内在的细胞进展路径。它包括数据预处理、初步PCA基因选择、初步细胞排序、特征选择、精细细胞排序以及分析后的解释和可视化。
作者:刘麦灿,陈浩,陈金淼
维护人员:Hao Chen
引文(从R内,输入引用(的作用)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(的作用)
超文本标记语言 | R脚本 | 快速启动 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBiology,DNASeq,GUI,ImmunoOncology,RNASeq,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.3.0), tcltk |
进口 | igraph,矩阵,RANN,RSpectra,VGAM,gplots平行,plyr、方法、集群,Biobase,fpc,BiocGenerics,单片眼镜, grDevices,图形,统计,utils |
链接 | |
建议 | knitr,RUnit,testthat,ggplot2 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | uSORT_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | uSORT_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | uSORT_1.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uSORT |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/uSORT |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/uSORT/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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