vidger

DOI:10.18129 / B9.bioc.vidger

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见vidger．

用R创建RNAseq数据的快速可视化

Bioconductor版本:3.10

vidger的目的是通过三种广泛使用的工具:Cuffdiff、DESeq2和edgeR快速生成信息丰富的可视化解释差异基因表达结果。

作者:Brandon Monier [aut, cre]， Adam McDermaid [aut]， Jing Zhao [aut]， Qin Ma [aut, fnd]

维护者:Brandon Monier < Brandon。Monier在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager" BiocManager::install("vidger")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“vidger”)

超文本标记语言	R脚本	用ViDGER可视化RNA-seq数据
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，RNASeq，软件，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor公司	BioC 3.7 (R-3.5)(2年)
许可证	GPL-3 |文件许可证
取决于	R (>= 3.5)
进口	Biobase，DESeq2，刨边机，GGally，ggplot2，ggrepel，knitr，RColorBrewer，rmarkdown，尺度统计数据,SummarizedExperiment，tidyr,跑龙套
链接
建议	BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/btmonier/vidger//www.andersvercelli.com/packages/release/bioc/html/vidger.html
BugReports	https://github.com/btmonier/vidger/issues
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	vidger_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	vidger_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	vidger_1.6.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vidger
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/vidger
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/vidger/
软件包下载报告	下载数据