txdb.hsapiens.ucsc.hg19

doi:10.18129/b9.bioc.txdb.hsapiens.ucsc.hg19

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅txdb.hsapiens.ucsc.hg19

TXDB对象的注释软件包

生物导体版本:3.10

通过将其公开为TXDB对象,暴露了从UCSC生成的注释数据库

作者:马克·卡尔森(Marc Carlson),bioconductor.org> [cre]的生物导体套件维护器<维护器

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“ txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nowngene”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nown)”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 AnnotationData,,,,遗传学,,,,homo_sapiens,,,,TXDB
版本 3.2.2
执照 艺术2.0
要看 GenomicFeatures(> = 1.21.30)
进口 AnnotationDbi
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我 注解,,,,嵌合体,,,,FDB.Infinium -Methylation.hg19,,,,funcisnp,,,,同性恋,,,,变体,,,,瓦肯
进口我 阿尔卑斯山,,,,感谢,,,,chipqc,,,,Chipseeker,,,,Demptumor2sig,,,,希尔达,,,,profileplyr,,,,Rarevariantvis,,,,RCGH
建议我 等位基因平衡,,,,AnnotationDbi,,,,Annotatr,,,,atacseqqc,,,,Beadarray,,,,Bioconcotk,,,,生物比较,,,,Biomvrcns,,,,Biovizbase,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,Bumphunter,,,,CGDV17,,,,chipenrich.data,,,,Chippeakanno,,,,Chromplot,,,,CPVSNP,,,,CRISPRSEEK,,,,德芬德,,,,derfinderplot,,,,esatac,,,,ga4ghclient,,,,ga4ghshiny,,,,量规,,,,基因贡献,,,,创世纪,,,,基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,GenomicsCores,,,,Genvisr,,,,GGBIO,,,,GMAPR,,,,gqtlstats,,,,grohmm,,,,Guideseq,,,,htseqgenie,,,,inpas,,,,核粒子,,,,桅杆,,,,甲基分析,,,,突变模式,,,,校长,,,,属属,,,,R3CPET,,,,地区报告,,,,肋骨蛋白,,,,rtracklayer,,,,sgseq,,,,sigfuge,,,,剪接图,,,,总结性特征,,,,tcgautils,,,,tfea.chip,,,,TrackViewer,,,,transcriptr,,,,tximport,,,,变体,,,,变体滤波器
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源包 txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nowngene_3.2.2.2.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/txdb.hsapiens.ucsc.hg19.nowngene/
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