HCAData

DOI:10.18129 / B9.bioc.HCAData

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见HCAData

在R/Bioconductor中访问人类细胞图谱数据集

Bioconductor版本:3.10

该包允许直接访问由Human Cell Atlas项目生成的数据集,以便在R和Bioconductor中进行进一步处理,格式为singlecellexperexperiment对象的舒适格式(可在这里获得其他格式:http://preview.data.humancellatlas.org/)。

作者:费德里科·马里尼[aut, cre]

维护者:Federico Marini

引用(从R中,输入引用(“HCAData”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("HCAData")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“HCAData”)

超文本标记语言 R脚本 访问人类细胞图谱数据集
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews ExperimentDataExperimentHubExpressionDataRNASeqDataSingleCellData
版本 1.2.0
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.6),SingleCellExperiment
进口 ExperimentHubAnnotationHubHDF5Array,跑龙套
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyle食物(> = 1.11.4),BiocSingularigraphiSEEtestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 HCAData_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/HCAData
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HCAData
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/HCAData/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: