此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见HCAData.
Bioconductor版本:3.10
该包允许直接访问由Human Cell Atlas项目生成的数据集,以便在R和Bioconductor中进行进一步处理,格式为singlecellexperexperiment对象的舒适格式(可在这里获得其他格式:http://preview.data.humancellatlas.org/)。
维护者:Federico Marini
引用(从R中,输入引用(“HCAData”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("HCAData")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“HCAData”)
超文本标记语言 | R脚本 | 访问人类细胞图谱数据集 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,RNASeqData,SingleCellData |
版本 | 1.2.0 |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.6),SingleCellExperiment |
进口 | ExperimentHub,AnnotationHub,HDF5Array,跑龙套 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,食物(> = 1.11.4),BiocSingular,嘘,igraph,iSEE,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | HCAData_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/HCAData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HCAData |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/HCAData/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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