hdcytodata

doi:10.18129/b9.bioc.hdcytodata

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅hdcytodata

收集生物导体对象格式的高维细胞仪基准数据集

生物导体版本:3.10

包含一组公开可用的高维细胞仪基准数据集的数据包,格式为SummarizedExperiment和Flowset Bioconductor对象格式,包括所有必需的元数据。行元数据包括样本ID,组ID,患者ID,参考细胞总体或群集标签(如果可用的地方),以及标记“在”单元格中识别“尖峰”的标签(如果可用的地方)。列元数据包括通道名称,蛋白质标记名称和蛋白质标记类(细胞类型或细胞状态)。

作者:Lukas M. Weber [AUT,CRE],Charlotte Soneson [AUT]

维护人员:lukas M. Weber

引用(从r内,输入引用(“ hdcytodata”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ hdcytodata”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ hdcytodata”)

html R脚本 1. HDCYTODATA软件包
html R脚本 2.示例和用例
html R脚本 3.贡献指南
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 实验数据,,,,实验室,,,,表达数据,,,,流环元素数据,,,,homo_sapiens_data,,,,ImmunooncologyData,,,,Singlecelldata
版本 1.6.6
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 实验室,,,,总结性特征,,,,流核
进口 UTILS,方法
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,RTSNE,,,,UMAP,,,,GGPLOT2,,,,流动,,,,mclust,,,,diffcyt
系统要求
增强
URL https://github.com/lmweber/hdcytodata
BugReports https://github.com/lmweber/hdcytodata/issues
取决于我 CytofworkFlow
进口我
建议我 diffcyt
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 hdcytodata_1.6.6.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hdcytodata
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/hdcytodata
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/hdcytodata/
软件包下载报告 下载统计

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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户