HMP16SDATA

doi:10.18129/b9.bioc.hmp16sdata

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅HMP16SDATA

来自人类微生物组项目的16S rRNA测序数据

生物导体版本:3.10

HMP16SDATA是人类微生物组项目(HMP)16S rRNA测序数据的生物导体实验包,用于可变区域1-3和3-5。从HMP数据分析和协调中心下载的软件包中提供了原始数据文件。通过实验室提供了处理后的数据作为总结性特征类对象。

作者:lucas schiffer ,rimsha azhar > hotmail.com>,marcel ramos 的marcel.ramos> roswellpark.org>,ludwig geistlinger ,Levi Waldron

维护者:lucas schiffer

引用(从r内,输入引用(“ HMP16SDATA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ hmp16sdata”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ HMP16SDATA”)

html R脚本 HMP16SDATA
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 实验数据,,,,实验室,,,,homo_sapiens_data,,,,微生物瘤,,,,reproducibleresearch,,,,序列数据
版本 1.6.0
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.6.0),总结性特征
进口 AnnotationHub,,,,断言,,,,dplyr,,,,实验室,,,,KableExtra,,,,尼特,,,,马格里特, 方法,readr,,,,S4VECTORS,,,,蒂布尔,UTILS
链接
建议 生物酶,,,,生物检查,,,,生物管理器,,,,生物使用,,,,循环,,,,COVR,,,,牛仔图,,,,策划的元素元素,,,,Dendextend,,,,DevTools,,,,GGPLOT2,,,,栅格,,,,避风港,,,,门索,,,,rmarkDown,,,,roxygen2,统计测试
系统要求
增强
URL https://github.com/waldronlab/hmp16sdata
BugReports https://github.com/waldronlab/hmp16sdata/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 hmp16sdata_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hmp16sdata
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/hmp16sdata
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/hmp16sdata/
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