此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅HMP2DATA。
生物导体版本:3.10
HMP2DATA是人类微生物组项目2(HMP2)16S rRNA测序数据的生物导体包。处理后的数据作为Thyloseq,SummarizedExperiment和MultiasSayExperiment类对象。包装中还提供了用于构建这些S4类对象的单个矩阵和数据。
作者:John Stansfield
维护者:John Stansfield
引用(从r内,输入引用(“ HMP2DATA”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ hmp2data”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ hmp2data”)
html | R脚本 | HMP2DATA |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 实验数据,,,,homo_sapiens_data,,,,微生物瘤,,,,reproducibleresearch,,,,序列数据 |
版本 | 1.0.0 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.6.0) |
进口 | AnnotationHub,,,,断言,,,,dplyr,,,,实验室,,,,KableExtra,,,,尼特,,,,马格里特, 方法,readr,,,,S4VECTORS,,,,总结性特征,,,,门索,,,,多亚sayExexperiment,,,,Data.Table |
链接 | |
建议 | 生物酶,,,,生物检查,,,,生物管理器,,,,生物使用,,,,牛仔图,,,,DevTools,,,,GGPLOT2,,,,栅格,,,,避风港,,,,rmarkDown,,,,roxygen2,统计测试,,,,蒂布尔,,,,insctr |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/jstansfield0/hmp2data |
BugReports | https://github.com/jstansfield0/hmp2data/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | hmp2data_1.0.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hmp2data |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/hmp2data |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/hmp2data/ |
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