此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅ihwpaper。
生物导体版本:3.10
该软件包便利地包装了在IHW纸中重现数字所需的所有功能(https://www.nature.com/articles/articles/nmeth.3885)和根据http://arxiv.orgs/1701.05179提供的最新ARXIV Preprint。因此,它是生物导体IHW软件包的配套软件包。
作者:Nikos Ignatiadis [AUT,CRE]
维护者:nikos ignatiadis
引用(从r内,输入引用(“ ihwpaper”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ihwpaper”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ ihwpaper”)
html | R脚本 | NMETH纸:解释TDR |
html | R脚本 | NMETH纸:IHW-Bonferroni模拟 |
html | R脚本 | NMETH纸:真实的数据示例 |
html | R脚本 | NMETH纸:模拟图 |
html | R脚本 | NMETH纸:分层直方图 |
html | R脚本 | 统计论文:IHW-Benjamini-Yekutieli的HQTL分析 |
html | R脚本 | 统计论文:IHW审查和楼层模拟 |
html | R脚本 | 各种:BH解释 /可视化 |
html | R脚本 | 各种:适用于IHW的Grenander估计器(VS ECDF) |
html | R脚本 | 各种:实际数据示例:1倍重量功能 |
html | R脚本 | 各种:TDR和PVALUE排斥区域 |
html | R脚本 | 各种:权重与独立过滤 |
参考手册 |
生物浏览 | 实验数据,,,,表达数据,,,,rnaseqdata,,,,reproducibleresearch |
版本 | 1.14.0 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.3),ihw |
进口 | RCPP,统计,细条,方法,utils,deseq2,,,,总结性特征,,,,fdrtool,,,,GeneFilter,,,,QVALUE,,,,生物酶,,,,生物基因,,,,生物比较,,,,dplyr, 网格,GGPLOT2,,,,牛仔图 |
链接 | RCPP |
建议 | 测试,,,,rcolorbrewer,,,,韦桑森,,,,秤,,,,栅格,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,呼吸道,,,,帕西拉,,,,deseq,,,,locfdr,,,,花花公子,,,,GGBIO,,,,LATEX2EXP |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ihwpaper_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ihwpaper |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ihwpaper |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ihwpaper/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |