rforpoteomics

doi：10.18129/b9.bioc.rforpoteomics

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅rforpoteomics。

伴侣包给“使用R和生物导体进行蛋白质组学数据分析”出版物

生物导体版本：3.10

该软件包包含代码，以说明使用R和Bioconductor手稿对蛋白质组学数据分析进行蛋白质组学数据分析的“使用R和Bioconductor”和“可视化”。小插图描述了复制论文中描述的示例和数字所需的代码和数据以及蛋白质组学可视化的功能。它还包含各种功能，以发现用于质谱和蛋白质组学的R软件。

作者：Laurent Gatto [AUT，CRE]，Thomas Lin Pedersen [CTB]，Sebastian Gibb [CTB]，Vlad Petyuk [CTB]

维护者：laurent Gatto

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ rforpoteomics”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Rforpoteomics”）

html	R脚本	使用R进行蛋白质组学数据分析
html	R脚本	使用R和生物导体可视化蛋白质组学数据
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	实验数据，，，，群众光谱，，，，reproducibleresearch
版本	1.24.0
执照	艺术2.0
要看	MSNBase（> = 2.5.3）
进口	r.utils，，，，闪亮的，，，，生物浏览，，，，生物管理器
链接
建议	AnnotationDbi，，，，rpx，，，，DT，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，MZR，，，，XCMS，，，，MSDATA，，，，isobar，，，，害怕（> = 1.12），马尔德方外，，，，readbrukerflexdata，，，，rtandem，，，，突触，，，，SynapterData，，，，ippd，，，，rdisop，，，，orgmassspecr，，，，总结性特征，，，，脑，，，，洛尔，，，，HPAR，，，，go.db，，，，org.hs.eg.db，，，，E1071，，，，Biomart，，，，rcolorbrewer，，，，GGPLOT2，，，，RESHAPE2，，，，Xtable，，，，格子，，，，mzid，，，，proloc，，，，prolocdata，，，，msgfplus，，，，MSNID，，，，msmstests，，，，MSMSEDA，，，，dep，，，，Corrplot，，，，beanplot，，，，热倍，，，，GPLOTS，，，，Venndiagram，，，，PROTVIZ，，，，GeneFilter，，，，情节，，，，栅格，，，，dplyr，，，，橄榄酸
系统要求
增强	切肉刀
URL	http://lgatto.github.com/rforproteomics/
取决于我
进口我
建议我	MSSTATSQC，，，，proteoqc，，，，QCMetrics
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rforpoteomics_1.24.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11（El Capitan）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rforproteomics
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rforpoteomics
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rforproteomics/
软件包下载报告	下载统计