mtbls2

doi:10.18129/b9.bioc.mtbls2

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅mtbls2

代谢MTBLS2:基于比较LC/MS的基于硝酸银的拟南芥叶片和CYP79B2 CYP79B3双基因敲除植物的分析。Böttcher等人。(2004)

生物导体版本:3.10

吲哚-3-乙酰氧霉菌(IAOX)代表了多种吲哚二次代谢产物的生物合成的早期中间体,包括植酸二醇-3-甲基甲基葡萄糖苷和苯甲酰甲基甲酸苯甲酰甲基酸酯(3-噻唑-2'-2'-2'-2'-yl-yl-dindole)。拟南芥CYP79B2 CYP79B3双基因敲除植物在色氨酸转化为吲哚-3-乙酰氧化霉菌中完全受损,并且不再积累IAOX衍生的代谢物。因此,对野生型和CYP79B2 CYP79B3植物系的比较分析有可能探索IAOX衍生的吲哚二级代谢物的完整范围。

作者:Steffen Neumann

维护者:Steffen Neumann

引用(从r内,输入引用(“ mtbls2”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mtbls2”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ mtbls2”)

html R脚本 MTBLS2处理和分析XCM,相机和导出到代谢
html R脚本 MTBLS2处理和分析XCMS3,摄像头和导出到代谢
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 实验数据,,,,群众光谱,,,,RepositorityData
版本 1.16.0
执照 CC0
要看 R(> = 2.10)
进口
链接
建议 XCMS(> = 3.0.0),相机,,,,Risa(> = 1.0.0),尼特,,,,热倍,,,,pcamethods,,,,sp
系统要求
增强
URL http://www.ebi.ac.uk/metabolights/mtbls2https://github.com/sneumann/mtbls2
取决于我
进口我
建议我 自动调节器,,,,IPO,,,,山药
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 mtbls2_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mtbls2
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/mtbls2
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/mtbls2/
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