pathprintGEOData

DOI:10.18129 / B9.bioc.pathprintGEOData

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见pathprintGEOData

路径指纹向量表示来自GEO数据存储库的阵列分段

Bioconductor版本:3.10

路径指纹向量已经从GEO语料库中预先计算了~390,000个公开可用的阵列,涵盖6个物种和31个平台。所有数据都伴随着相关的元数据。

作者:Gabriel Altschuler, Sokratis Kariotis

维护者:Sokratis Kariotis

引文(从R内,输入引用(“pathprintGEOData”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“pathprintGEOData”)

PDF R脚本 pathprintGEOData
PDF 参考手册

细节

biocViews Caenorhabditis_elegans_DataDanio_rerio_DataDrosophila_melanogaster_DataExperimentDataExpressionData地理基因组Homo_sapiens_DataMicroarrayDataMus_musculus_DataOneChannelDataPathwayInteractionDatabaseRattus_norvegicus_DataSequencingDataTwoChannelData
版本 1.16.0
许可证 GPL
取决于 R (>= 3.4)
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建议 pathprintSummarizedExperiment
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增强了
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 pathprintGEOData_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathprintGEOData
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pathprintGEOData
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/pathprintGEOData/
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