这个包是版本3.10的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见tximportData。
Bioconductor版本:3.10
该软件包提供了对GEUVADIS项目的一组6个RNA-seq样本运行各种转录本丰度定量器的输出。量词是袖扣、RSEM、kallisto、Salmon和旗鱼。有关版本号、示例信息和调用的详细信息,请参见软件包插图。
作者:Michael Love
维护者:Michael Love
引用(来自R,输入引用(“tximportData”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager",悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tximportData")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放。
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“tximportData”)
超文本标记语言 | R脚本 | timximport的示例输出文件 |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,RNASeqData,SequencingData |
版本 | 1.14.0 |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | KnowSeq |
建议我 | DESeq2,HumanTranscriptomeCompendium,tximeta,tximport,variancePartition |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | tximportData_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/tximportData |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/tximportData |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/tximportData/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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