注释

doi:10.18129/b9.bioc.annotationforge

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅注释

构建基于SQLITE的注释数据包的工具

生物导体版本:3.11

提供用于生成注释软件包及其数据库的代码。生产的包装旨在与AnnotationDBI一起使用。

作者:马克·卡尔森(Marc Carlson),赫维·帕格斯(HervéPagès)

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“注释”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ AnnotationForge”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ AnnotationForge”)

PDF R脚本 注释:为自定义注释资源创建选择接口
PDF R脚本 创建探针软件包
html R脚本 制作新生物包
PDF R脚本 SQLFORGE:使用标准数据库架构创建新的注释软件包的一种简单方法。
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.30.1
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(8年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.5.0),方法,utils,生物基因(> = 0.15.10),生物酶(> = 1.17.0),AnnotationDbi(> = 1.33.14)
进口 DBI,,,,rsqlite,,,,XML,,,,S4VECTORS,,,,rcurl
链接
建议 Biomart,,,,httr,,,,GenomeInfodB(> = 1.17.1),生物弦,,,,副词,,,,HGU95AV2.DB,,,,Human.DB0,,,,org.hs.eg.db,,,,同性恋,,,,hom.hs.inp.db,,,,go.db,,,,生物使用,,,,尼特,,,,生物管理器
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 AnnotationHubdata,,,,gghhumanmethcancerpanelv1.db,,,,gostats,,,,Viseago
建议我 AnnotationDbi,,,,AnnotationHub
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 AnnotationForge_1.30.1.tar.gz
Windows二进制 AnnotationForge_1.30.1.zip
MacOS 10.13(高山脉) AnnotationForge_1.30.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annotationforge
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/注释
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/annotationforge/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户