此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见BiocFileCache.
Bioconductor版本:3.11
这个包创建一个持久的磁盘文件缓存,用户可以添加、更新和检索这些文件。它对于管理昂贵或难以创建的资源(如自定义Txdb对象)、web资源和跨会话使用的数据文件非常有用。
作者:Lori Shepherd [aut, cre], Martin Morgan [aut]
维护者:Lori Shepherd < Lori。Shepherd在roswellpark.org>
引文(从R内,输入引用(“BiocFileCache”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("BiocFileCache")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“BiocFileCache”)
超文本标记语言 | R脚本 | BiocFileCache:跨会话管理文件资源 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,软件 |
版本 | 1.12.1 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.4.0),dbplyr(> = 1.0.0) |
进口 | 方法,统计,效用,dplyr,RSQLite,DBI,rappdirs,旋度,httr |
链接 | |
建议 | testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown,rtracklayer |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/Bioconductor/BiocFileCache/issues |
全靠我 | AnnotationHub,ExperimentHub,RcwlPipelines |
进口我 | 意大利苦杏酒,atSNP,BiocPkgTools,biomaRt,brendaDb,cbaf,cBioPortalData,CellBench,CTDquerier,easyRNASeq,EnrichmentBrowser,EpiTxDb,GAPGOM,GSEABenchmarkeR,HCABrowser,MBQN,netDx,org.Mxanthus.db,Organism.dplyr,PANTHER.db,psichomics,regutools,SingleCellMultiModal,tximeta,UniProt.ws,waddR |
建议我 | basilisk.utils,BiocOncoTK,BiocSet,chipseqDB,fluentGenomics,HighlyReplicatedRNASeq,HumanTranscriptomeCompendium,后代,嘘,scRNAseq,seqsetvis,simpleSingleCell,structToolbox,TCGAutils,TENxBrainData,TENxPBMCData,TimeSeriesExperiment |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | BiocFileCache_1.12.1.tar.gz |
Windows二进制 | BiocFileCache_1.12.1.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | BiocFileCache_1.12.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocFileCache |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocFileCache |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/BiocFileCache/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: