类别

DOI:10.18129 / B9.bioc.Category

该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见类别。

类别分析

Bioconductor版本:3.11

执行类别(基因集富集)分析的工具集合。

作者:Robert Gentleman [aut]， Seth Falcon [cbr]， Deepayan Sarkar [cbr]， Robert Castelo [cbr]， Bioconductor Package维护者[cbr]

维护者:Bioconductor Package维护者< maintainer@bioconductor.org >

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"，悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Category")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“类别”)

PDF	R脚本	使用分类分析微阵列数据
PDF	R脚本	以染色体带作为分类
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，去，GeneSetEnrichment，通路，软件
版本	2.54.0
在Bioconductor中	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法、stats4BiocGenerics，AnnotationDbi，Biobase，矩阵
进口	跑龙套,统计数据,图，RBGL，GSEABase，genefilter，注释，DBI
链接
建议	EBarrays，所有，Rgraphviz，RColorBrewer，xtable(> = 1.4 6),hgu95av2.db，KEGG.db，karyoploteR，geneplotter，limma，晶格，RUnit，org.Sc.sgd.db，GOstats，GO.db
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	GOstats，PCpheno
进口我	狂欢节，categoryCompare，cellHTS2，eisa，gCMAP，GmicR，interactiveDisplay，meshr，miRLAB，PCpheno，phenoTest，ppiStats，RDAVIDWebService，ReportingTools，scTensor
建议我	BiocCaseStudies，GSEAlm，MmPalateMiRNA，qpgraph，RnBeads
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	Category_2.54.0.tar.gz
Windows二进制	Category_2.54.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	Category_2.54.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/Category
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/Category
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Category/
软件包下载报告	下载数据