群体意义

doi:10.18129/b9

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅群体意义

clustersimentimance软件包提供了工具来评估维度降低数据表示的类别簇是否具有与排列数据不同的分离

生物导体版本:3.11

clustersimence软件包提供了工具来评估降低数据表示的类别簇是否具有与置换数据不同的分离。此处的“类别簇”术语是指代表数据中已知类别的点簇。这对于确定变量的子集(例如特定途径中的基因可以单独将样本分为这些既定类别。clustersimence可以通过将所有点投射到一维线上来实现这一目标。然后对群集分离进行评分,并使用置换方法评估观察分离的可能性。

作者:Jason T. Serviss [AUT,CRE],Jesper R. Gadin [AUT]

维护者:Jason T Serviss

引用(从r内,输入引用(“ clustersimentimance”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ clusterstimentimance”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ clustersimentimance”)

html R脚本 clustersimence vignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 分类,,,,聚类,,,,委托人,,,,软件,,,,统计信息
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(4。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.3.0)
进口 方法,pracma,,,,普林斯(> = 2.0.5),STACTPLOT3D,,,,rcolorbrewer,grdevices,图形,utils,统计
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,生物使用,,,,GGPLOT2,,,,PLS基因组学,,,,COVR
系统要求
增强
URL https://github.com/jasonserviss/clustersignificance/
BugReports https://github.com/jasonserviss/clustersignific/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 clustersimance_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 clustersimance_1.16.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) clustersimance_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clustersnificance
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/clustersimance
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/clustersignificance/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户