此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅群体意义。
生物导体版本:3.11
clustersimence软件包提供了工具来评估降低数据表示的类别簇是否具有与置换数据不同的分离。此处的“类别簇”术语是指代表数据中已知类别的点簇。这对于确定变量的子集(例如特定途径中的基因可以单独将样本分为这些既定类别。clustersimence可以通过将所有点投射到一维线上来实现这一目标。然后对群集分离进行评分,并使用置换方法评估观察分离的可能性。
作者:Jason T. Serviss [AUT,CRE],Jesper R. Gadin [AUT]
维护者:Jason T Serviss
引用(从r内,输入引用(“ clustersimentimance”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ clusterstimentimance”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ clustersimentimance”)
html | R脚本 | clustersimence vignette |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 分类,,,,聚类,,,,委托人,,,,软件,,,,统计信息 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(4。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.3.0) |
进口 | 方法,pracma,,,,普林斯(> = 2.0.5),STACTPLOT3D,,,,rcolorbrewer,grdevices,图形,utils,统计 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,生物使用,,,,GGPLOT2,,,,PLS基因组学,,,,COVR |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/jasonserviss/clustersignificance/ |
BugReports | https://github.com/jasonserviss/clustersignific/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | clustersimance_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | clustersimance_1.16.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | clustersimance_1.16.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clustersnificance |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/clustersimance |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/clustersignificance/ |
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