CrossICC

DOI:10.18129 / B9.bioc.CrossICC

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CrossICC．

面向多平台数据分析的交互式共识聚类框架

Bioconductor版本:3.11

CrossICC采用迭代策略，从共识聚类生成的共识相似矩阵中推导出最佳的基因集和聚类数，能够处理多个跨平台数据集，不需要数据集之间的归一化。这个包还提供了丰富的功能，用于可视化和识别癌症的亚型。特别是，许多与癌症相关的分析方法被嵌入，以促进临床翻译已识别的癌症亚型。

作者:孙宇[aut, cre]，赵琦[au]

维护人员:Yu Sun

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“CrossICC”)

超文本标记语言	R脚本	如何使用CrossICC?
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BatchEffect，分类，聚类，DifferentialExpression，FeatureExtraction，GUI，GeneExpression，GeneSetEnrichment，微阵列，归一化，预处理，RNASeq，软件，生存，可视化
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (R-3.6)(1年)
许可证	GPL-3 |文件许可证
取决于	R (> = 3.5),质量
进口	data.table、方法、MergeMaid，ConsensusClusterPlus，limma，集群，dplyr，Biobase， grDevices，统计，图形，utils
链接
建议	rmarkdown，testthat，knitr，闪亮的，shinydashboard，shinyWidgets，shinycssloaders，DT，ggthemes，ggplot2，pheatmap，RColorBrewer，宠物猫，ggalluvial
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	CrossICC_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	CrossICC_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	CrossICC_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CrossICC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CrossICC
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CrossICC/
包下载报告	下载数据