DominoEffect

DOI:10.18129 / B9.bioc.DominoEffect

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见DominoEffect．

蛋白质热点残基的识别与注释

Bioconductor版本:3.11

该函数支持蛋白质热点残基的识别和注释。这些是单个氨基酸，它们积累突变的速度比周围区域要快得多。

作者:Marija Buljan和Peter Blattmann

维护者:Marija Buljan < Marija . Buljan。2在gmail.com>， Peter Blattmann < Blattmann at imsb.biol.ethz.ch>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“DominoEffect”)

超文本标记语言	R脚本	插图为多米诺效应包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，蛋白质组学，SequenceMatching，软件，SomaticMutation
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (R-3.5)(2.5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.5)
进口	biomaRt，data.table,跑龙套,统计数据,Biostrings，SummarizedExperiment，VariantAnnotation，AnnotationDbi，GenomeInfoDb，IRanges，GenomicRanges、方法
链接
建议	knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	DominoEffect_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	DominoEffect_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	DominoEffect_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DominoEffect
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DominoEffect
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DominoEffect/
包下载报告	下载数据