EpiDISH

DOI:10.18129 / B9.bioc.EpiDISH

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见EpiDISH．

样本内异质性的表观遗传学解剖

Bioconductor版本:3.11

EpiDISH是一个R包，用于推断样本中存在的先验已知细胞类型的比例，该细胞类型代表这些细胞类型的混合物。目前，该包装可用于全血、一般上皮组织和乳腺组织的DNAm数据。此外，该软件包还提供了一个功能，允许识别不同的甲基化细胞类型及其在表观基因组全关联研究中的变化方向。

作者:Andrew E. Teschendorff ，郑世杰

维护人员:Shijie Charles Zheng

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“EpiDISH”)

超文本标记语言	R脚本	样本内异质性的表观遗传学解剖
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，DifferentialMethylation，表观遗传学，ImmunoOncology，MethylationArray，软件
版本	测试盒框
Bioconductor自	BioC 3.6 (R-3.4)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.5)
进口	质量，e1071，quadprog、并行数据,matrixStats，stringr，locfdr
链接
建议	roxygen2，GEOquery，BiocStyle，knitr，rmarkdown，Biobase，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/sjczheng/EpiDISH
BugReports	https://github.com/sjczheng/EpiDISH/issues
取决于我	烤面包
进口我
建议我	FlowSorted.Blood.EPIC
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	EpiDISH_2.4.0.tar.gz
Windows二进制	EpiDISH_2.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	EpiDISH_2.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EpiDISH
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EpiDISH
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/EpiDISH/
包下载报告	下载数据