有限元法

DOI:10.18129 / B9.bioc.FEM

此包适用于Bioconductor的3.11版本。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见有限元法．

功能表观遗传模块的鉴定

Bioconductor版本:3.11

FEM包对DNA甲基化和基因表达数据进行系统级的综合分析。它寻找功能相关的基因模块，显示差异启动子DNA甲基化和差异表达，其中启动子DNA甲基化和基因表达之间的负相关假设。详情请参见Jiao et al Bioinformatics 2014。

作者:Andrew E. Teschendorff，杨震

维护者:Zhen Yang

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("FEM")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“有限元”)

PDF	R脚本	该FEM包对DNA甲基化和基因表达进行系统级的综合分析。它寻找功能相关的基因模块，显示差异启动子DNA甲基化和差异表达，其中启动子DNA甲基化和基因表达之间的负相关假设。详情请参见Jiao et al Bioinformatics 2014。
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，DifferentialMethylation，NetworkEnrichment，软件，SystemsBiology
版本	3.15.0
在Bioconductor公司	bio 3.0 (R-3.1)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	AnnotationDbi，矩阵，marray，corrplot，igraph，嫁祸于，limma，org.Hs.eg.db，图，BiocGenerics
进口	图
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	FEM_3.15.0.tar.gz
Windows二进制	FEM_3.15.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/FEM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FEM
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/FEM/
软件包下载报告	下载数据