GOsummaries

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOsummaries

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GOsummaries

GO富集分析的词云总结

Bioconductor版本:3.11

一个用于可视化基因本体论(GO)富集分析结果的包,这些结果来自不同的分析,如聚类或PCA。重要的GO类别被可视化为词云,可以与总结底层数据的不同图相结合。

作者:Raivo Kolde < Raivo。在eesti.ee kolde >

维护者:Raivo Kolde < Raivo。在eesti.ee kolde >

引用(从R中,输入引用(“GOsummaries”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“GOsummaries”)

PDF R脚本 GOsummaries基础知识
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类GeneExpression软件可视化
版本 2.24.0
Bioconductor自 bio 3.0 (R-3.1)(6年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.15),Rcpp
进口 plyr、网格gProfileRreshape2limmaggplot2gtable
链接 Rcpp
建议 素食主义者
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/raivokolde/GOsummaries
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 GOsummaries_2.24.0.tar.gz
Windows二进制 GOsummaries_2.24.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) GOsummaries_2.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOsummaries
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GOsummaries
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GOsummaries/
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