此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅gseabase。
生物导体版本:3.11
该软件包提供了支持基因集富集分析(GSEA)的类和方法。
作者:马丁·摩根(Martin Morgan),塞思·法尔康(Seth Falcon)
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ gseabase”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gseabase”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ gseabase”)
R脚本 | GSEABase简介 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 去,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,GraphandNetwork,,,,kegg,,,,软件 |
版本 | 1.50.1 |
在生物导体中 | Bioc 2.1(R-2.6)(13年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.6.0),生物基因(> = 0.13.8),生物酶(> = 2.17.8),注释(> = 1.45.3),方法,图形(> = 1.37.2) |
进口 | AnnotationDbi,,,,XML |
链接 | |
建议 | HGU95AV2.DB,,,,go.db,,,,org.hs.eg.db,,,,rgraphviz,,,,报告工具,,,,测试,,,,生物使用,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | Agdex,,,,Bicare,,,,ccpromise,,,,CPVSNP,,,,GCMAP,,,,GSVADATA,,,,NPGSEA,,,,承诺,,,,碎片,,,,Tissueenrich |
进口我 | Aucell,,,,生物剂,,,,癌症,,,,类别,,,,类别Compare,,,,CellHTS2,,,,富集兄弟,,,,gcmapweb,,,,gep2pep,,,,GISPA,,,,Globalancova,,,,GMICR,,,,GSRI,,,,GSVA,,,,Migsa,,,,mirsm,,,,莫格萨,,,,OPPAR,,,,PCPHENO,,,,表,,,,邮政,,,,承诺,,,,rcistarget,,,,报告工具,,,,sctgif,,,,SignaturesEarch,,,,唱歌,,,,singscoreamlmutations,,,,激流回旋,,,,tfutils |
建议我 | 生物探测,,,,生物群,,,,量规,,,,全球测试,,,,gostats,,,,GSAR,,,,gsealm,,,,桅杆,,,,PGSEA,,,,表,,,,Singlecelltk,,,,tfea.chip |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | gseabase_1.50.1.tar.gz |
Windows二进制 | gseabase_1.50.1.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | gseabase_1.50.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gseabase |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/gseabase |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/gseabase/ |
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