GSRI

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSRI

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GSRI．

基因集调控指数

Bioconductor版本:3.11

GSRI软件包利用基因集调控指数(GSRI)的概念估计了基因集中差异表达基因的数量。

作者:Julian Gehring, Kilian Bartholome, Clemens Kreutz, Jens Timmer

维护者:Julian Gehring

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GSRI")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“GSRI”)

PDF	R脚本	GSRI包简介:利用基因集调控指数估算调控效应
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneRegulation，GeneSetEnrichment，微阵列，软件，转录
版本	2.36.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (R-2.11)(10.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.14.2),fdrtool
进口	方法，图形，统计，工具，genefilter，Biobase，GSEABase，莱斯(> = 1.1.6)
链接
建议	limma，hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了	平行
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GSRI_2.36.0.tar.gz
Windows二进制	GSRI_2.36.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GSRI_2.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSRI
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GSRI
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GSRI/
包下载报告	下载数据