免疫空间

doi:10.18129/b9.bioc.mumunespacer

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅免疫空间

Immunespace数据库周围的薄包装器

生物导体版本:3.11

提供了方便的API,用于访问Immunespace(www.immunespace.org)内的数据集,人类免疫学项目财团(HIPC)的数据存储库和分析平台。

作者:Greg Finak [Aut],Renan Sauteraud [aut],Mike Jiang [aut],Gil Guday [aut],Leo Dashevskiy [aut],Evan Henrich [aut],Ju Yeong Kim [aut],Lauren Wolfe [aut],Helen Miller [AUT],Raphael Gottardo [AUT],Immunespace软件包维护器[CRE,CPH]

维护者:Immunespace软件包维护器

引用(从r内,输入引用(“免疫空间”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ immunespacer”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“免疫空间”)

html R脚本 免疫包裹的简介
html R脚本 使用GetDataset下载数据集
html R脚本 用免疫空间处理表达矩阵
html R脚本 Interactive_netrc()函数演练
html R脚本 SDY144:HAI/病毒中和滴度和细胞计数的相关性
html R脚本 SDY180:通过多参数流式细胞术测量的质量质量
html R脚本 SDY269:将HAI与流式细胞术和ELISPOT结果相关联
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,软件,,,,第三派对人
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(4。5年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 3.5.0)
进口 utils,R6,,,,Data.Table,,,,卷曲,,,,httr,,,,rlabkey(> = 2.3.1),生物酶,,,,pheatmap,,,,GGPLOT2(> = 3.2.0),,统计GPLOTS,,,,情节,,,,热图(> = 0.7.0),jsonlite,,,,rmarkDown,,,,预处理,,,,流核,,,,FlowWorkspace,,,,消化
链接
建议 尼特,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/rglab/immunespacer
BugReports https://github.com/rglab/immunespacer/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Immunespacer_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 Immunespacer_1.16.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Immunespacer_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/immunespacer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/免疫空间
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/immunespacer/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户