此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅kegglincs。
生物导体版本:3.11
通过从KGML文件获得的信息中明确创建路径映射,查看KEGG路径的“引擎盖下方”的情况。
作者:Shana White
维护者:shana White
引用(从r内,输入引用(“ kegglincs”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ kegglincs”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ kegglincs”)
html | R脚本 | kegglincs工作流程 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 细胞生物学,,,,datarepresentation,,,,基因表达,,,,GraphandNetwork,,,,kegg,,,,网络,,,,网络引导,,,,途径,,,,软件,,,,第三派对人 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(4年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.3),科达塔,,,,HGU133A.DB,,,,org.hs.eg.db(> = 3.3.0) |
进口 | AnnotationDbi,,,,kegggraph,,,,Igraph,,,,plyr,,,,gtools,,,,httr,,,,rjsonio,,,,keggrest,方法,图形,统计,utils,XML,grdevices |
链接 | |
建议 | 生物管理器(> = 1.20.3),尼特,,,,图形 |
系统要求 | Cytoscape(> = 3.3.0),Java(> = 8) |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | kegglincs_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | kegglincs_1.14.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | kegglincs_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/kegglincs |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/kegglincs |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/kegglincs/ |
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