KEGGprofile

DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGprofile

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见KEGGprofile．

KEGG通路中多类型多组表达数据的注释和可视化包

Bioconductor版本:3.11

KEGGprofile是一个集成了KEGG路径图中的表达式配置文件和功能注释的注释和可视化工具。多类型、多组的表达数据可以在一个路径图中可视化。KEGGprofile有助于更详细地分析不同基因和样本的特定功能变化内在通路或时间相关性。

作者:赵世林，郭燕，于夏

维护者:赵世林<世林。赵在vanderbilt.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("KEGGprofile")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“KEGGprofile”)

PDF	R脚本	KEGGprofile:应用示例
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	KEGG，通路，软件
版本	1.30.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(8年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于
进口	AnnotationDbi，png，TeachingDemos，XML，KEGG.db，KEGGREST，biomaRt，RCurl，ggplot2，reshape2
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	IntramiRExploreR
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	KEGGprofile_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	KEGGprofile_1.30.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	KEGGprofile_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGprofile
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/KEGGprofile
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/KEGGprofile/
软件包下载报告	下载数据