M3D

DOI:10.18129 / B9.bioc.M3D

这个包是弃用．它可能会被从生物导体中移除。请参阅包临终的指导方针为更多的信息。

此包适用于Bioconductor的3.11版本。这个包已经从Bioconductor中移除。有关最后一个稳定的、最新的发布版本，请参见M3D．

识别不同测试组的甲基化区域

Bioconductor版本:3.11

该包识别统计学上显著差异的cpg甲基化区域。它使用核方法(最大平均差异)来测量甲基化分布的差异，并将这些与复制间的变化联系起来，同时考虑覆盖分布的变化。

作者:汤姆·梅奥

维护人员:汤姆·梅奥

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("M3D")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“M3D”)

PDF	R脚本	M$^3$D方法简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，CpGIsland，DNAMethylation，DifferentialMethylation，软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (R-3.1)(6年)
许可证	艺术授权2.0
取决于	R (> = 3.3.0)
进口	平行,Rcpp，BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，SummarizedExperiment，BiSeq
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	M3D_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	M3D_1.22.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	M3D_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/M3D
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ M3D
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/M3D/
包下载报告	下载数据