MMUPHin

DOI:10.18129 / B9.bioc.MMUPHin

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见MMUPHin．

微生物组研究异质性的统一管道元分析方法

Bioconductor版本:3.11

MMUPHin是一个用于微生物组群元分析任务的R包。它具有以下功能接口:a)协变量控制的批和队列效应调整，b)元分析差异丰度检验，c)无监督离散结构(聚类)发现元分析，d)无监督连续结构发现元分析。

作者:马本

维护者:Siyuan MA

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“MMUPHin”)

超文本标记语言	R脚本	MMUPHin
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BatchEffect，宏基因组，微生物组，软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (R-3.6)(1年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.6)
进口	Maaslin2，metafor，fpc，igraph，ggplot2，dplyr，tidyr，cowplot， utils, stats, grDevices
链接
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown，magrittr，素食主义者，phyloseq，curatedMetagenomicData，genefilter
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MMUPHin_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MMUPHin_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MMUPHin_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MMUPHin
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MMUPHin
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MMUPHin/
包下载报告	下载数据