MSstatsTMT

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstatsTMT

该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见MSstatsTMT．

基于串联质量标签(TMT)标记的散弹枪质谱蛋白质组学实验中的蛋白质显著性分析

Bioconductor版本:3.11

基于串联质量标签(TMT)标记的散弹枪质谱的蛋白质组学实验中蛋白质显著性分析工具。

作者:黄婷[aut, cre]， Meena Choi [aut]，郝思成[aut]， Olga Vitek [aut]

维护者:黄婷

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MSstatsTMT")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“MSstatsTMT”)

超文本标记语言	R脚本	MSstatsTMT用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件
版本	1.6.6
在Bioconductor中	BioC 3.8 (R-3.5)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)
进口	limma，lme4，lmerTest，dplyr，tidyr，statmod、方法、reshape2，data.table，matrixStats，统计，utils，ggplot2、grDevices、图形、MSstats
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	http://msstats.org/msstatstmt/
BugReports	https://groups.google.com/forum/ !论坛/ msstats
这取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	MSstatsTMT_1.6.6.tar.gz
Windows二进制	MSstatsTMT_1.6.6.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MSstatsTMT_1.6.6.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsTMT
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/MSstatsTMT
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MSstatsTMT/
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