MaxContrastProjection

DOI:10.18129 / B9.bioc.MaxContrastProjection

这个包是Bioconductor的3.11版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅MaxContrastProjection。

执行一个最大对比度沿z维3 d图像投影到二维

Bioconductor版本:3.11

记录三维荧光显微图像时的一个问题是如何正确地在2 d呈现这些结果。最大强度的预测是一个流行的方法来确定图像中每个像素的焦平面。然而,这种方法的问题是,失焦元素仍可见,使边缘和精细结构难以检测。这个包旨在解决这个问题通过使用给定的像素周围的对比来确定焦平面,允许更清洁的结构比将检测成为可能。为了方便起见,这个包还包含函数来执行各种其他类型的预测,包括最大强度投影。

作者:简·萨奥尔,贝恩德•费舍尔

维护人员:1月萨奥尔< 1月。萨奥尔在dkfz-heidelberg.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MaxContrastProjection”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MaxContrastProjection”)

PDF	R脚本	MaxContrastProjection
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays,ImmunoOncology,预处理,软件,可视化
版本	1.11.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4)
进口	EBImage、统计数据、方法
链接
建议	knitr,BiocStyle,testthat
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	MaxContrastProjection_1.11.0.tar.gz
Windows二进制	MaxContrastProjection_1.11.0.zip
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MaxContrastProjection
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MaxContrastProjection
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MaxContrastProjection/
包下载报告	下载数据