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NCIgraph
DOI:10.18129 / B9.bioc.NCIgraph
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅NCIgraph。
从数据库NCI通路途径
Bioconductor版本:3.11
提供了各种方法来加载路径从NCI通路数据库在R图对象和需要格式化您所需要。
作者:洛朗•雅各布
维护人员:Laurent雅各<劳伦。雅各在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“NCIgraph”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“NCIgraph”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“NCIgraph”)
| R脚本 | NCIgraph: NCI通路的网络集成数据库作为graphNEL对象。 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | GraphAndNetwork,通路,软件 |
| 版本 | 1.36.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(9.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 2.10.0) |
| 进口 | 图,KEGGgraph、方法、RBGL,RCy3,R.methodsS3 |
| 链接 | |
| 建议 | Rgraphviz |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | DEGraph |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | DEGraph |
| 建议我 | DEGraph |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | NCIgraph_1.36.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NCIgraph |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NCIgraph |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/NCIgraph/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
