NanoStringDiff

DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringDiff

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见NanoStringDiff．

纳米串nCounter数据的差分表达式分析

Bioconductor版本:3.11

该软件包利用负二项族的广义线性模型(GLM)来表征计数数据，并允许多因素设计。NanoStrongDiff在模型框架中结合了大小因子(从阳性对照和管家对照计算得到)和背景水平(从阴性对照计算得到)，以便充分利用NanoString nCounter Analyzer提供的所有归一化信息。

作者:王宏<宏。王在uky.edu>，tingting zhai , chi wang

维护者:婷婷斋<婷婷。翟在uky.edu>，王宏<宏。王在uky.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("NanoStringDiff")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“NanoStringDiff”)

PDF	R脚本	NanoStringDiff装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，归一化，软件
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(5年)
许可证	GPL
取决于	Biobase
进口	matrixStats、方法、Rcpp
链接	Rcpp
建议	testthat，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	NanoStringDiff_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	NanoStringDiff_1.18.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	NanoStringDiff_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringDiff
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NanoStringDiff
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/NanoStringDiff/
软件包下载报告	下载数据