OmnipathR

DOI:10.18129 / B9.bioc.OmnipathR

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见OmnipathR．

导入全路径网络

Bioconductor版本:3.11

从https://www.omnipathdb.org webservice导入数据。它还包括转换和打印这些数据的函数。

作者:Attila Gabor, Denes Turei, Alberto Valdeolivas

维护者:Alberto Valdeolivas Urbelz

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“OmnipathR”)

超文本标记语言	R脚本	利用OmnipathR建立围绕药物靶点的蛋白质网络
PDF	R脚本	OmnipathR:在R中使用OmnipathR的实用函数
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，GraphAndNetwork，网络，通路，软件，ThirdPartyClient
版本	1.2.1 "
在Bioconductor	bio3.10 (R-3.6)(1年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6.0)，igraph，图形，方法，utils
进口	dplyr，rlang
链接
建议	tidyr，dnet，gprofiler2，BiocStyle，testthat，knitr，rmarkdown，ggplot2，ggraph
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/saezlab/OmnipathR
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	OmnipathR_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	OmnipathR_1.2.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	OmnipathR_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OmnipathR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/OmnipathR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/OmnipathR/
软件包下载报告	下载数据