此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅Panvizgenerator。
生物导体版本:3.11
Panviz是一种基于JavaScript的可视化工具,用于功能性注释的pangenomes。Panvizgenerator是Panviz的伴侣,它促进了创建工作panviz可视化所需的必要数据预处理步骤。输出完全独立,因此可视化的接收者不需要安装r或panvizgenerator。
作者:托马斯·林·佩德森
维护者:thomas lin pedersen
引用(从r内,输入引用(“ panvizgenerator”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ panvizgenerator”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ panvizgenerator”)
html | R脚本 | 使用panvizgenerator创建panviz可视化 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 比较基因组学,,,,GUI,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(4。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | 方法 |
进口 | 闪亮的, 工具,jsonlite,,,,pcamethods,,,,Findmyfriends,,,,Igraph,统计,utils |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,消化 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/thomasp85/panvizgenerator |
BugReports | https://github.com/thomasp85/panvizgenerator/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | panvizgenerator_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | panvizgenerator_1.16.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | panvizgenerator_1.16.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/panvizgenerator |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/panvizgenerator |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/panvizgenerator/ |
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