Panvizgenerator

doi:10.18129/b9.bioc.panvizgenerator

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅Panvizgenerator

从您的pangenome产生panviz的可视化

生物导体版本:3.11

Panviz是一种基于JavaScript的可视化工具,用于功能性注释的pangenomes。Panvizgenerator是Panviz的伴侣,它促进了创建工作panviz可视化所需的必要数据预处理步骤。输出完全独立,因此可视化的接收者不需要安装r或panvizgenerator。

作者:托马斯·林·佩德森

维护者:thomas lin pedersen

引用(从r内,输入引用(“ panvizgenerator”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ panvizgenerator”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ panvizgenerator”)

html R脚本 使用panvizgenerator创建panviz可视化
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 比较基因组学,,,,GUI,,,,软件,,,,可视化
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(4。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 方法
进口 闪亮的, 工具,jsonlite,,,,pcamethods,,,,Findmyfriends,,,,Igraph,统计,utils
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,消化
系统要求
增强
URL https://github.com/thomasp85/panvizgenerator
BugReports https://github.com/thomasp85/panvizgenerator/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 panvizgenerator_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 panvizgenerator_1.16.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) panvizgenerator_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/panvizgenerator
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/panvizgenerator
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/panvizgenerator/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户