RMassBank

DOI:10.18129 / B9.bioc.RMassBank

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RMassBank。

工作流过程串联文件女士和构建MassBank记录

Bioconductor版本:3.11

工作流过程串联文件女士和构建MassBank记录。功能包括自动提取光谱女士串联,公式分配串联女士片段,调整与指定片段串联女士光谱,光谱清理,自动从互联网数据库,检索化合物信息和出口MassBank记录。

作者:迈克尔•Stravs艾玛·Schymanski Steffen Neumann埃里克•穆勒Schulze托拜厄斯的贡献

维护人员:RMassBank Eawag < massbank在eawag.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RMassBank”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RMassBank”)

PDF	R脚本	RMassBank非标准用法
PDF	R脚本	RMassBank使用XCMS预排
PDF	R脚本	RMassBank预排
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学,ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,软件
版本	2.16.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Rcpp
进口	XML,RCurl,rjson,S4Vectors,消化,rcdk,yaml,mzR、方法、Biobase,MSnbase,httr,enviPat
链接
建议	gplots,RMassBankData,xcms(> = 1.37.1),相机,RUnit
SystemRequirements	OpenBabel
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	RMassBankData
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	RMassBank_2.16.0.tar.gz
Windows二进制	RMassBank_2.16.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	RMassBank_2.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RMassBank
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RMassBank
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RMassBank/
包下载报告	下载数据