RNAmodR

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAmodR

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RNAmodR．

检测高通量测序数据的转录后修饰

Bioconductor版本:3.11

RNAmodR为从高通量测序中加载/聚合数据提供类和工作流程，旨在通过分析特定模式检测转录后修饰。此外，还提供了验证和可视化结果的实用程序。RNAmodR包提供了一个核心功能，具体的分析策略可以很容易地作为一个单独的包实现。

作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre]，丹尼斯·拉方丹[ctb, fft]

维护人员:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RNAmodR")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“RNAmodR”)

超文本标记语言	R脚本	RNAmodR
超文本标记语言	R脚本	RNAmodR -为新的检测策略创建新类
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文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，测序，软件，可视化，WorkflowStep
版本	1.2.3
Bioconductor自	BioC 3.10 (R-3.6)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6),IRanges(> = 2.21.6),S4Vectors(> = 0.25.14),GenomicRanges，Modstrings
进口	方法、统计grDevices,matrixStats，BiocGenerics，Biostrings(> = 2.55.7),BiocParallel，GenomicFeatures，GenomicAlignments，GenomeInfoDb，rtracklayer，Rsamtools，BSgenome，RColorBrewer，colorRamps，ggplot2，Gviz(> = 1.31.0),reshape2、图形、ROCR
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，RNAmodR。数据
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR
BugReports	https://github.com/FelixErnst/RNAmodR/issues
取决于我	RNAmodR。AlkAnilineSeq，RNAmodR。毫升，RNAmodR。RiboMethSeq
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	RNAmodR_1.2.3.tar.gz
Windows二进制	RNAmodR_1.2.3.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	RNAmodR_1.2.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAmodR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAmodR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RNAmodR/
包下载报告	下载数据