ReQON

DOI:10.18129 / B9.bioc.ReQON

该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ReQON

重新校准核苷酸的质量

Bioconductor版本:3.11

BAM格式序列数据基本质量分数的再校准算法。

作者:Christopher Cabanski, Keary Cavin, Chris Bizon

维护者:Christopher Cabanski

引用(来自R,输入引用(“ReQON”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ReQON")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“ReQON”)

PDF R脚本 ReQON教程
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews HighThroughputSequencing预处理质量控制测序软件
版本 1.34.0
在Bioconductor中 BioC 2.9 (R-2.14)(9岁)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.0.2),Rsamtoolsseqbias
进口 rJava,图形,统计,utils, grDevices
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements Java版本>= 1.6
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 ReQON_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 ReQON_1.34.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ReQON_1.34.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/ReQON
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ReQON
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ReQON/
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