RpsiXML

DOI:10.18129 / B9.bioc.RpsiXML

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RpsiXML．

R接口到PSI-MI 2.5文件

Bioconductor版本:3.11

查询、数据结构和交互数据集可视化的接口。这个包实现了PSI-MI 2.5标准，目前支持8个数据库。支持PSI-MI 2.5标准的数据库将不断增加。

作者:Jitao David Zhang, Stefan Wiemann, Marc Carlson, Tony Chiang撰稿

维护者:Jitao David Zhang

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("RpsiXML")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RpsiXML”)

PDF	R脚本	RpsiXML包的应用实例
PDF	R脚本	读取PSI-25 XML文件
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,蛋白质组学,软件
版本	2.30.0
在Bioconductor	BioC 2.3 (R-2.8)(12年)
许可证	LGPL-3
取决于	方法,注释(> = 1.21.0),图(> = 1.21.0),Biobase,RBGL(> = 1.17.0),XML(> =测试盒框),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi
进口
链接
建议	org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,hom.Hs.inp.db,hom.Mm.inp.db,hom.Dm.inp.db,hom.Rn.inp.db,hom.Sc.inp.db,Rgraphviz,ppiStats,ScISI
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com
全靠我	ScISI
进口我	ScISI
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	RpsiXML_2.30.0.tar.gz
Windows二进制	RpsiXML_2.30.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	RpsiXML_2.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RpsiXML
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RpsiXML
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RpsiXML/
软件包下载报告	下载数据