SPIA

DOI:10.18129 / B9.bioc.SPIA

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见SPIA．

信号通路影响分析(SPIA)使用通路过度表达和异常信号扰动的联合证据

Bioconductor版本:3.11

该软件包实现了信号通路影响分析(SPIA)，该分析使用差异表达基因及其对数折叠变化以及信号通路拓扑结构的信息，以确定与研究条件最相关的通路。

作者:Adi Laurentiu Tarca ， Purvesh Kathri < Purvesh at cs.wayne.edu>和Sorin Draghici < Sorin at wayne.edu>

维护者:Adi Laurentiu Tarca

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SPIA")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SPIA”)

PDF	R脚本	SPIA
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	GraphAndNetwork，微阵列，软件
版本	2.40.0
在Bioconductor	BioC 2.4 (R-2.9)(11.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R(>= 2.14.0)，图形，KEGGgraph
进口	图形
链接
建议	图，Rgraphviz，hgu133plus2.db
SystemRequirements
增强了
URL	http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/btn577v1
全靠我
进口我	EnrichmentBrowser
建议我	石墨，KEGGgraph
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	SPIA_2.40.0.tar.gz
Windows二进制	SPIA_2.40.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	SPIA_2.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPIA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SPIA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SPIA/
软件包下载报告	下载数据