Scale4C

DOI:10.18129 / B9.bioc.Scale4C

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见Scale4C．

Scale4C:一个R/Bioconductor包，用于4C-seq数据的尺度-空间转换

Bioconductor版本:3.11

Scale4C是一个R/Bioconductor包，用于4C-seq数据的尺度空间转换和可视化。尺度空间变换是一种多尺度可视化技术，通过应用不同的平滑核(高斯，σ增加)，将二维信号(例如在选择的基因组区间上的4C-seq读取)转换为尺度空间(2D，基因组位置x尺度因子)中的镶嵌。这种转换允许对数据结构与其他样本进行探索性分析和比较。

作者:卡罗琳·沃尔特

维护者:Carolin Walter < Carolin。Walter在uni-muenster.de>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Scale4C")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“Scale4C”)

PDF	R脚本	Scale4C:一个R/Bioconductor包，用于4C-seq数据的尺度-空间转换
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文本		新闻

细节

biocViews	报道，DataImport，质量控制，测序，软件，可视化
版本	1.10.0
在Bioconductor公司	BioC 3.6 (R-3.4)(3年)
许可证	LGPL-3
取决于	R (>= 3.4)，奶昔，GenomicRanges，IRanges，SummarizedExperiment
进口	方法，grDevices，图形，utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	Scale4C_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	Scale4C_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	Scale4C_1.10.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/Scale4C
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Scale4C
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Scale4C/
软件包下载报告	下载数据