aCGH

DOI:10.18129 / B9.bioc.aCGH

该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见aCGH

阵列比较基因组杂交数据的类和函数

Bioconductor版本:3.11

从图像分析输出文件和克隆信息文件中读取aCGH数据,创建aCGH S3对象用于存储这些数据。访问/替换,子集,打印和绘制aCGH对象的基本方法。

作者:Jane Fridlyand , Peter Dimitrov < Dimitrov at stat.Berkeley.EDU>

维护者:Peter Dimitrov < Dimitrov at stat.Berkeley.EDU>

引用(来自R,输入引用(“aCGH”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("aCGH")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“aCGH”)

PDF R脚本 aCGH概述
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariationDataImport遗传学软件
版本 1.66.0
在Bioconductor中 BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.10),集群生存
进口 Biobase, grDevices,图形,方法,统计,样条,工具
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我 CRImage
进口我 ADaCGH2rCGHsnapCGH
建议我 beadarraySNP
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 aCGH_1.66.0.tar.gz
Windows二进制 aCGH_1.66.0.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra) aCGH_1.66.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/aCGH
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/aCGH
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/aCGH/
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