该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affyQCReport.
Bioconductor版本:3.11
这个包为AffyBatch对象创建一个QC报告。该报告旨在允许用户快速评估AffyBatch对象中一组数组的质量。
作者:Craig Parman < Craig。Parman在bix.org >,Conrad Halling
维护者:Craig Parman < Craig。Parman在bix.org >
引用(来自R,输入引用(“affyQCReport”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" affyqreport ")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“affyQCReport”)
R脚本 | affyqreport:生成Affymetrix QC报告的方法 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,质量控制,软件 |
版本 | 1.66.0 |
在Bioconductor中 | BioC 1.7 (R-2.2)(15年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | Biobase(> = 1.13.16),affy,晶格 |
进口 | affy,affyPLM,Biobase,genefilter、图形、grDevices、晶格,RColorBrewer,simpleaffy,统计,utils,xtable |
链接 | |
建议 | tkWidgets(> = 1.5.23),affydata(> = 1.4.1) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | BiocCaseStudies |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | affyQCReport_1.66.0.tar.gz |
Windows二进制 | affyQCReport_1.66.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | affyQCReport_1.66.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/affyQCReport |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ affyqreport |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/affyQCReport/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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