affyQCReport

DOI:10.18129 / B9.bioc.affyQCReport

该软件包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affyQCReport

生成affyBatch对象的QC报告

Bioconductor版本:3.11

这个包为AffyBatch对象创建一个QC报告。该报告旨在允许用户快速评估AffyBatch对象中一组数组的质量。

作者:Craig Parman < Craig。Parman在bix.org >,Conrad Halling , Robert Gentleman

维护者:Craig Parman < Craig。Parman在bix.org >

引用(来自R,输入引用(“affyQCReport”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" affyqreport ")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“affyQCReport”)

PDF R脚本 affyqreport:生成Affymetrix QC报告的方法
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列OneChannel质量控制软件
版本 1.66.0
在Bioconductor中 BioC 1.7 (R-2.2)(15年)
许可证 LGPL (>= 2)
取决于 Biobase(> = 1.13.16),affy晶格
进口 affyaffyPLMBiobasegenefilter、图形、grDevices、晶格RColorBrewersimpleaffy,统计,utils,xtable
链接
建议 tkWidgets(> = 1.5.23),affydata(> = 1.4.1)
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我 BiocCaseStudies
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 affyQCReport_1.66.0.tar.gz
Windows二进制 affyQCReport_1.66.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) affyQCReport_1.66.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/affyQCReport
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ affyqreport
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/affyQCReport/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: