培根

DOI:10.18129 / B9.bioc.bacon

此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见培根

利用经验零分布控制关联研究中的偏倚和膨胀

Bioconductor版本:3.11

培根可以用来去除膨胀和偏差,通常在表观基因组和转录组范围的关联研究中观察到。为此,bacon通过在z分数上拟合三组分正态混合物,使用吉布斯采样算法构建了一个经验零分布。

作者:Maarten van Iterson [aut, cre], Erik van Zwet [ctb]

维护:Maarten van Iterson

引用(从R中,输入引用(培根)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("bacon")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

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超文本标记语言 R脚本 利用经验零分布控制关联研究中的偏倚和膨胀
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细节

biocViews BatchEffect贝叶斯GenomeWideAssociationImmunoOncologyMethylationArrayMultipleComparisonRNASeq回归软件StatisticalMethod转录组
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 3.3 (R-3.3)(4.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(>= 3.3),方法,统计,ggplot2、图形、BiocParallel椭圆
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建议 BiocStyleknitrrmarkdowntestthatroxygen2
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 bacon_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 bacon_1.16.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) bacon_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bacon
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/培根
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/bacon/
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