此包适用于Bioconductor的3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见培根.
Bioconductor版本:3.11
培根可以用来去除膨胀和偏差,通常在表观基因组和转录组范围的关联研究中观察到。为此,bacon通过在z分数上拟合三组分正态混合物,使用吉布斯采样算法构建了一个经验零分布。
作者:Maarten van Iterson [aut, cre], Erik van Zwet [ctb]
维护:Maarten van Iterson
引用(从R中,输入引用(培根)
):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("bacon")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(培根)
超文本标记语言 | R脚本 | 利用经验零分布控制关联研究中的偏倚和膨胀 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BatchEffect,贝叶斯,GenomeWideAssociation,ImmunoOncology,MethylationArray,MultipleComparison,RNASeq,回归,软件,StatisticalMethod,转录组 |
版本 | 1.16.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.3 (R-3.3)(4.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(>= 3.3),方法,统计,ggplot2、图形、BiocParallel,椭圆 |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,roxygen2 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | bacon_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | bacon_1.16.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | bacon_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bacon |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/培根 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/bacon/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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