癌症

doi:10.18129/b9.bioc.cancer

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅癌症

用于访问和建模MSKCC癌症基因组学数据的图形用户界面

生物导体版本:3.11

该软件包是基于CGDSR和其他建模包的用户友好界面,用于探索,比较和分析所有可用的癌症数据(临床数据,基因突变,基因甲基化,基因表达,蛋白质磷酸化,拷贝数,拷贝数改变),由计算生物学托管位于纪念 - 斯通 - 凯特林癌症中心(MSKCC)的中心。

作者:Karim Mezhoud。核安全部。突尼斯核科学中心。

维护者:gmail.com上的karim mezhoud

引用(从r内,输入引用(“癌症”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“癌症”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 GUI,,,,基因表达,,,,软件
版本 1.22.01
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(5。5年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.4),tcltk,TCLTK2,,,,CGDSR
进口 gseabase,,,,TKRPLOT,,,,GenetClassifier,,,,运行,,,,公式,,,,rpart,,,,生存,,,,生物酶,,,,,,,,循环,,,,plyr,图形,统计,utils,grdevices
链接
建议 测试(> = 0.10.0),R.RSP
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 癌症1.22.01.tar.gz
Windows二进制 cancer_1.22.01.zip
MacOS 10.13(高山脉) 癌症1.22.01.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cancer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/癌症
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cancer/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户