CBAF

doi:10.18129/b9.bioc.cbaf

此软件包适用于3.11版的生物导体;对于稳定的最新版本,请参阅CBAF

自动化功能,用于比较cbioportal.org的各种imic数据

生物导体版本:3.11

该软件包包含允许在各种癌症/癌症亚组之间进行分析和比较的功能。到目前为止,它与存储在cbioportal.org上的RNA-seq,microRNA-Seq,微阵列和甲基化数据集兼容。

作者:Arman Shahrisa [AUT,CRE,CPH],Maryam Tahmasebi Birgani [aut]

维护者:Arman Shahrisa

引用(从r内,输入引用(“ CBAF”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cbaf”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ CBAF”)

html R脚本 CBAF
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 测定域,,,,生物医学信息学,,,,比较基因组学,,,,DNAMETHYLATY,,,,表观遗传学,,,,基因表达,,,,遗传学,,,,研究菲尔德,,,,软件,,,,转录,,,,转录组学
版本 1.10.1
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(3年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.5.0)
进口 Biocfilecache,,,,rcolorbrewer,,,,CGDSR,,,,GeneFilter,,,,GPLOTS,grdevices,统计,utils,xlsx
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cbaf_1.10.1.tar.gz
Windows二进制 cbaf_1.10.1.zip
MacOS 10.13(高山脉) cbaf_1.10.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbaf
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cbaf
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/cbaf/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户